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오늘은 많은 기업에서 매년 관심을 갖고 참여하는 중소기업 혁신바우처 사업의 “2025년 버전”과 “2026년 버전”이 어떻게 달라졌는지 아주 쉽게 비교해드리려 합니다.
두 공고문은 얼핏 보면 비슷해 보이지만, 지원금 구조·보조율·지역우대·지원제외 기준·사업기간·기술지원 범위 등 여러 부분에서 중요한 변화가 있습니다.
특히 2026년에는 지역 균형발전 우대 정책이 강화되었고, 중복지원·공급기업 관련 제약 규정이 더 명확하게 정리되는 등 실무적으로 영향을 주는 변화가 꽤 많습니다.
기업 담당자이시라면 이번 비교 포스팅을 꼭 참고하시고, 2026년 사업 준비에 차질 없도록 하세요!
① 지원 구조 및 사업 운영 변화｜예산·기간·구조 비교
키워드: #사업기간 #예산규모 #운영체계 #바우처구조
2025년과 2026년 혁신바우처는 기본 골격은 동일하지만 운영 기간과 예산, 일부 절차에서 차이가 있다. 먼저 예산 규모는 2026년에 652억 원으로 책정되었으며 이는 정부안 기준으로 이후 변동 가능성이 있다는 점이 명시되었다.
반면 2025년 공고문에서는 전체 예산이 명시되지 않았거나 일부 유형 중심으로 제시되어 상대적으로 정보가 덜 구체적이다.
사업 기간에서도 차이가 있다. 2025년에는 대부분의 과제가 2025년 7월 말까지 결과물 제출이었고, 융복합 컨설팅 등 일부 유형만 9월 말까지 수행이 가능했다.
하지만 2026년 공고에서는 일반바우처 2026년 7월 말, 중대재해·탄소중립은 2026년 9월 말까지로 보다 명확하게 사업별 종료 시점을 구분했다. 특히 재기컨설팅은 2027년 10월까지 수행할 수 있어 기간 범위가 더 넓게 설정되었다.
바우처 운영 절차는 두 해 모두 ▲신청 ▲평가 ▲협약 ▲바우처 발급 ▲수행 ▲정산 순으로 유사하지만, 2026년에는 공급기업-운영기관 간 계약 구조를 좀 더 명확히 정리해 절차적 혼란을 줄였다. 기술지원 프로그램에서도 2025년에는 기업당 2개 이상 선택 가능했던 요소가, 2026년 탄소중립 분야에서는 1개 프로그램만 선택 가능하도록 변경되었다는 차이도 있다.
② 지원대상·제외대상 강화 비교｜공급기업·중복지원 규정 변화 중심
키워드: #지원대상 #신청제외 #중복지원 #공급기업제한
두 해 모두 기본 지원대상은 제조업(C업종) 기반 중소기업으로 동일하다. 하지만 신청 제외 대상 규정은 2026년에 더 강화되었다.
2025년에는 “최근 5년간 3회 이상 지원받은 기업”이 제외였던 반면, 2026년에는 총 5회 이상 지원받은 기업으로 강화 기준이 변경되었다.
또한 2025년에는 “신청한 분야에서 수행기관과 특수관계”가 제외 사유였으나, 2026년에는 이를 명확히 확장해 수행기관뿐만 아니라 공급기업·운영기관까지 모든 참여 기관과 특수관계일 경우 신청 불가로 변경되었다.이는 이해충돌 방지를 위한 강화 조치로 볼 수 있다.
중복지원 기준도 2026년이 더 구체화되었다. 2025년에는 “유사·중복 지원 내용”만을 기준으로 했다면, 2026년에는 동 사업 뿐 아니라 타 부처 사업과 중복되는 경우까지 명시적으로 제한했다. 또한 “2025년 바우처 잔액 보유 시 2026년 신청 불가” 조항이 새롭게 명기되었다.
결론적으로 2026년 공고는 지원 남용 방지와 형평성 제고를 위한 규정 강화가 가장 큰 특징이다.
③ 보조율·지역우대 정책 변화｜2026년 강화 포인트 명확화
키워드: #보조율변화 #지역우대 #정부지원비율 #균형발전정책
보조율은 두 해 모두 매출액 규모에 따라 차등 적용된다.
2025년 보조율은 최저 40%~최대 85% 구조였으며, 120억~1,500억 기업도 40% 지원이 가능했다.
2026년에는 기본 구간이 유사하지만 상한선을 140억 이하로 변경했으며, 140억 초과 기업은 일반바우처 참여 대상에서 제외된 것으로 해석된다.
가장 큰 변화는 지역 우대정책 강화이다.
2025년에는 우대정책이 상대적으로 간단한 형태로 운영되었지만, 2026년에는 특별지원지역, 우대지원지역, 일반(비수도권)으로 세분화하여 5~15%p 보조율 우대를 제공하는 체계가 도입되었다.
즉 2026년 지방기업의 경우 실질 지원율이 최대 95%까지 증가할 수 있어 지역 균형발전 정책이 대폭 강화된 해이다.
④ 프로그램 구성·실무 절차 변화｜기술지원·신청서류·평가 방식 차이
키워드: #평가절차 #기술지원 #신청서류 #AI평가
2025년과 2026년 모두 컨설팅·기술지원·마케팅으로 구성된 일반바우처 구조는 동일하지만, 프로그램 복수 신청 가능 범위, 기술지원 분야의 선택 가능성에서 변화가 있다.
특히 탄소중립 분야에서 2025년은 기술지원 2개 이상 가능했지만 2026년에는 1개 프로그램만 허용해 사업 집중도를 높였다.
신청서류는 큰 틀은 동일하나, 2026년에는 표준재무제표 연도가 2022~2024년으로 변경되었고, 민원증명자료 제출 방식도 “중소기업지원 플랫폼”에서 “원클릭 서비스”로 용어가 바뀌었다. 이는 시스템 통합 개선의 신호로 해석할 수 있다.
평가절차에서도 변화가 있다.
2025년 평가 단계는 ▲서면심사 ▲현장평가 ▲위원회였던 반면, 2026년에는 ▲서면심사 ▲AI진단+현장평가 ▲위원회로 구성되며 AI 기반 진단 요소가 공식 반영되었다. AI 도입은 평가 공정성 및 일관성 강화를 위한 중요한 변화다.
또한 중복지원 방지 및 공급기업 적격성 심사 역시 강화되어, 2026년 공고는 실무적 관리 요소가 촘촘하게 정비된 것이 특징이다.
📌 정리하며
2025년 대비 2026년 혁신바우처 사업은 지원대상 관리 강화·지역우대 확대·AI 평가 도입·프로그램 선택 제한 조정 등 정책 방향성이 더욱 명확해졌습니다. 특히 지방 소재 제조기업에게는 2026년이 훨씬 유리한 해입니다.
🟩 핵심 요약 — 한눈에 보는 변화 포인트
✅ 2026년은 이렇게 달라졌다!
- 지역기업 우대가 크게 강화 → 최대 95% 지원 가능
- 평가에 AI 자동진단 도입 → 평가 공정성 강화
- 중복지원 및 이해관계 제한 강화 → 공급기업·운영기관까지 포함
- 탄소중립 기술지원 선택 폭 축소(1개로 제한)
- 사업기간이 분야별로 명확하게 구조화
- 지원대상 매출 상한 140억 중심으로 재정리
결론적으로, 2026년 혁신바우처는 지방기업·안전·탄소중립·재기컨설팅 분야에 더 무게가 실린 구조로 진화했습니다.
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